Javier Hernández es doctor habilitado como profesor titular y máster en Historia y Estética de la Cinematografía. En la Universidad Europea de Madrid ha impartido distintas asignaturas relacionadas con la historia del arte, el cine y la teoría de los nuevos medios audiovisuales. También ha trabajado como profesor en la Escuela de Cine de la Comunidad de Madrid (ECAM), la Escuela Universitaria de Diseño, Innovación y Tecnología (ESNE) y los Másteres de Historia y Estética de Cinematografía de la Universidad de Valladolid y de Producción Transmedia en la Universitat Autònoma de Barcelona. Además, ha desarrollado su labor docente e investigadora en diversas universidades internacionales de Estados Unidos, Gran Bretaña, Suecia, Portugal, Chile y Francia.
Entre sus publicaciones destacan las monografías sobre directores del cine español y las relaciones entre el cine con la literatura y el arte. Ha sido uno de los recuperadores del patrimonio cinematográfico aragonés dando a conocer materiales inéditos de Antonio Maenza, Antonio Artero, Adolfo Aznar o Moncayo Films, presentes en publicaciones monográficas, así como en otras más generales como Cineastas aragoneses (1992), Diccionario de aragoneses en el cine y vídeo (1994) y las entradas de la Gran Enciclopedia Aragonesa.
Ha colaborado como experto en cine en Heraldo de Aragón y en El Periódico de Aragón desde su fundación, así como en revistas especializadas como Dirigido por, Imágenes de actualidad o Cine divergente ; así mismo ha sido guionista de documentales y ficción, productor (Ulysses Films, ITACA) y storyteller de proyectos transmedia.